Los Congresos de la SECH son congresos nacionales de interés general para todos los sectores de la Horticultura. Se realizan bianualmente y en ellos se tratan todas las áreas de trabajo de la sociedad comprendidas dentro de sus 12 Grupos de Trabajo:

Alimentación y Salud, Economía, Fertiirrigación y sustratos, Fresón y otros Frutos Rojos, Fruticultura y Citricultura, Ingeniería Hortícola, Mejora Genética, Olivicultura, Ornamentales, Post-recolección e Industria y Viticultura.